お父様のご逝去、お悔やみ申し上げます。
さて、農業組合からの請求ですが、時効の主張ができる可能性があります。ただし、債務を一部でも支払ったり、認めたりすると主張できなくなる恐れがありますので、慎重に主張して下さい。
そのほか、お父様のご逝去（をお知りになった）時点から３か月が経過していなければ、家庭裁判所に相続放棄の手続きをとることもできます。ただし、この場合は、最初からお父様の相続人でなかったこととなり、資産も相続できませんのでご注意下さい。
どちらも難しいとなっても、交渉により減額される余地はあるように思います。一度、請求書をお持ちになって、専門家に相談されることをお勧めします。